Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 UBP3YER151C 2739 nt1.17□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.16□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.16□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.16□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.16□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.16□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 RPS25BYLR333C 327 nt1.16□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.16□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 YGR069WYGR069W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.15□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 VAM6YDL077C 3150 nt1.15□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 GEA2YEL022W 4380 nt1.15□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 CSE2YNR010W 450 nt1.14□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.14□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YOR218CYOR218C 420 nt1.14□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.14□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 RAD61YDR014W 1944 nt1.14□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 RPS27BYHR021C 249 nt1.13□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 ECM12YHR021W-A 456 nt1.13□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YBR206WYBR206W 324 nt1.13□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 UTP20YBL004W 7482 nt1.13□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 COG8YML071C 1824 nt1.12□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YDR521WYDR521W 336 nt1.12□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YER181CYER181C 324 nt1.12□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YNL028WYNL028W 318 nt1.12□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.12□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 KAP120YPL125W 3099 nt1.12□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 SPO21YOL091W 1830 nt1.12□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YDL196WYDL196W 330 nt1.11□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YMR321CYMR321C 318 nt1.11□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YJL120WYJL120W 324 nt1.1□□□□□ -2.23
RTP1Q12751 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.07□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 IES4YOR189W 351 nt1.07□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 YBR064WYBR064W 429 nt1.07□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 DOP1YDR141C 5097 nt1.06□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 SGF11YPL047W 300 nt1.06□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 MCM10YIL150C 1716 nt1.06□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 OLI1Q0130 231 nt1.05□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 SCC2YDR180W 4482 nt1.05□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 ISD11YER048W-A 285 nt1.04□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.04□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 YCR022CYCR022C 345 nt1.03□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 YOL014WYOL014W 375 nt1.03□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 YOR282WYOR282W 321 nt1.03□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 BEM2YER155C 6504 nt1.03□□□□□ -2.24
RTP1Q12751 YGL052WYGL052W 306 nt1.02□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.02□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.02□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YOR015WYOR015W 360 nt1.02□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YPR117WYPR117W 7470 nt1.01□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.01□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YPR092WYPR092W 306 nt1.01□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.99□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.99□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.98□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 snR49snR49 165 nt0.98□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 CMC4YMR194C-B 222 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YNL211CYNL211C 261 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YPL044CYPL044C 549 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 YMR160WYMR160W 2451 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 RKR1YMR247C 4689 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
RTP1Q12751 snR55snR55 98 nt0.95□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 PAA1YDR071C 576 nt0.95□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 NOP9YJL010C 2001 nt0.94□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 PMP1YCR024C-A 123 nt0.94□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.94□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.94□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 snR74snR74 88 nt0.93□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YDL073WYDL073W 2955 nt0.93□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YGL041CYGL041C 204 nt0.92□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.92□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.91□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.91□□□□□ -2.26
RTP1Q12751 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.9□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 RPL26BYGR034W 384 nt0.9□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 snR8snR8 190 nt0.89□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.88□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.88□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 PRP16YKR086W 3216 nt0.87□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.86□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 ABF2YMR072W 552 nt0.86□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 NPR2YEL062W 1848 nt0.85□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 SEC1YDR164C 2175 nt0.85□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.85□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.85□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 COY1YKL179C 2040 nt0.84□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
RTP1Q12751 YKU70YMR284W 1809 nt0.84□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 snR80snR80 171 nt0.83□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.83□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 BIR1YJR089W 2865 nt0.82□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 YDR366CYDR366C 399 nt0.82□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 snR190snR190 190 nt0.82□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 CHS6YJL099W 2241 nt0.82□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.81□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 YLR282CYLR282C 342 nt0.81□□□□□ -2.28
RTP1Q12751 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
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