Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 BEM2YER155C 6504 nt1.13□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 SMC1YFL008W 3678 nt1.12□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 YJR029WYJR029W 5268 nt1.12□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.12□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 CSE2YNR010W 450 nt1.12□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 YOR218CYOR218C 420 nt1.12□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 OLI1Q0130 231 nt1.11□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 UBP3YER151C 2739 nt1.11□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.1□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.1□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.1□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.1□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.1□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 PAM16YJL104W 450 nt1.1□□□□□ -2.23
SEC39Q12745 RAD61YDR014W 1944 nt1.09□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 snR65snR65 100 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YNL028WYNL028W 318 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 SGF11YPL047W 300 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 MCM10YIL150C 1716 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 KAP120YPL125W 3099 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 SPT7YBR081C 3999 nt1.08□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 PRP16YKR086W 3216 nt1.07□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YGR069WYGR069W 336 nt1.06□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.06□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 IES4YOR189W 351 nt1.06□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YOR015WYOR015W 360 nt1.05□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YDL073WYDL073W 2955 nt1.04□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YDL196WYDL196W 330 nt1.03□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 CMC4YMR194C-B 222 nt1.03□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 YNL211CYNL211C 261 nt1.03□□□□□ -2.24
SEC39Q12745 ISD11YER048W-A 285 nt1.02□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 NOP9YJL010C 2001 nt1.02□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.02□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YPL044CYPL044C 549 nt1.02□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 UTP20YBL004W 7482 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 PAA1YDR071C 576 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.99□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 QCR9YGR183C 201 nt0.98□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YGL052WYGL052W 306 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YOR282WYOR282W 321 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
SEC39Q12745 YPR092WYPR092W 306 nt0.95□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 ASE1YOR058C 2658 nt0.94□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 RPL26BYGR034W 384 nt0.94□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.94□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.94□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.94□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 RKR1YMR247C 4689 nt0.93□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 PMP1YCR024C-A 123 nt0.93□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YER181CYER181C 324 nt0.93□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.92□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 snR74snR74 88 nt0.91□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.91□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.91□□□□□ -2.26
SEC39Q12745 YPR117WYPR117W 7470 nt0.9□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.89□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 snR49snR49 165 nt0.88□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.87□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.86□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.85□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 NPR2YEL062W 1848 nt0.85□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.84□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 YOL014WYOL014W 375 nt0.84□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 snR190snR190 190 nt0.84□□□□□ -2.27
SEC39Q12745 YMR160WYMR160W 2451 nt0.83□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 COY1YKL179C 2040 nt0.83□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 SEC8YPR055W 3198 nt0.83□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 CHS6YJL099W 2241 nt0.81□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 snR55snR55 98 nt0.81□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YLR282CYLR282C 342 nt0.81□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.81□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.8□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.79□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.79□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.79□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YCR022CYCR022C 345 nt0.78□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YGL041CYGL041C 204 nt0.78□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 BLI1YKL061W 342 nt0.78□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.78□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.78□□□□□ -2.28
SEC39Q12745 SEC1YDR164C 2175 nt0.77□□□□□ -2.29
SEC39Q12745 YML002WYML002W 2214 nt0.77□□□□□ -2.29
SEC39Q12745 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.77□□□□□ -2.29
SEC39Q12745 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.77□□□□□ -2.29
SEC39Q12745 FYV10YIL097W 1551 nt0.77□□□□□ -2.29
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