Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 YOR015WYOR015W 360 nt0.9□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 SMC1YFL008W 3678 nt0.9□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 ECM12YHR021W-A 456 nt0.89□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 VIK1YPL253C 1944 nt0.89□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 BEM2YER155C 6504 nt0.89□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 OLI1Q0130 231 nt0.88□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 YMR321CYMR321C 318 nt0.88□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.87□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 GEA2YEL022W 4380 nt0.87□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 RKR1YMR247C 4689 nt0.87□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 BFR2YDR299W 1605 nt0.86□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 YGL149WYGL149W 306 nt0.86□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 RPL39YJL189W 156 nt0.86□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 YNL211CYNL211C 261 nt0.86□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 SGF11YPL047W 300 nt0.86□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 RPS27BYHR021C 249 nt0.85□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 CMC4YMR194C-B 222 nt0.85□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 NOP9YJL010C 2001 nt0.84□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 CSE2YNR010W 450 nt0.84□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.83□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 DOP1YDR141C 5097 nt0.83□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.82□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.82□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 IES4YOR189W 351 nt0.82□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 RAD61YDR014W 1944 nt0.81□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.81□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 ISD11YER048W-A 285 nt0.81□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.81□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 PMP1YCR024C-A 123 nt0.8□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.8□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.8□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YNL146WYNL146W 303 nt0.8□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 PAU24YBR301W 363 nt0.79□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YPR117WYPR117W 7470 nt0.78□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.78□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YNL028WYNL028W 318 nt0.78□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 YOR218CYOR218C 420 nt0.78□□□□□ -2.28
HMS1Q12398 snR65snR65 100 nt0.77□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YGR069WYGR069W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YPL044CYPL044C 549 nt0.77□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 snR74snR74 88 nt0.76□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.76□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.75□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YOR282WYOR282W 321 nt0.75□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YGL052WYGL052W 306 nt0.74□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 PAM16YJL104W 450 nt0.73□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.73□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 LTE1YAL024C 4308 nt0.73□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 MYO1YHR023W 5787 nt0.72□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 CHS6YJL099W 2241 nt0.72□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 PAA1YDR071C 576 nt0.72□□□□□ -2.29
HMS1Q12398 HAL9YOL089C 3093 nt0.71□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 YPR092WYPR092W 306 nt0.71□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 PRP5YBR237W 2550 nt0.7□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.7□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 RPL26BYGR034W 384 nt0.69□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.69□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 SEC1YDR164C 2175 nt0.69□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 FYV10YIL097W 1551 nt0.68□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.68□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 snR190snR190 190 nt0.68□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 NPR2YEL062W 1848 nt0.67□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.67□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.67□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 COY1YKL179C 2040 nt0.66□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.66□□□□□ -2.3
HMS1Q12398 STF2YGR008C 255 nt0.65□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.65□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 UBP3YER151C 2739 nt0.65□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 SEC8YPR055W 3198 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 ULI1YFR026C 510 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YLR282CYLR282C 342 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 HUG1YML058W-A 207 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YOR345CYOR345C 351 nt0.64□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YML002WYML002W 2214 nt0.63□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 COX12YLR038C 252 nt0.63□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YSP1YHR155W 3687 nt0.62□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.62□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YCR022CYCR022C 345 nt0.61□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 OST4YDL232W 111 nt0.61□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YER181CYER181C 324 nt0.61□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.61□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YLR041WYLR041W 321 nt0.61□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 RPS30BYOR182C 192 nt0.61□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.6□□□□□ -2.31
HMS1Q12398 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
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