Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 ISD11YER048W-A 285 nt1.2□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 ECM12YHR021W-A 456 nt1.2□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.19□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YOR225WYOR225W 330 nt1.19□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 snR14snR14 160 nt1.19□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 KIP1YBL063W 3336 nt1.18□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 ULI1YFR026C 510 nt1.18□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 RPL33BYOR234C 324 nt1.18□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 CDC31YOR257W 486 nt1.18□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 AIM44YPL158C 2277 nt1.18□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 IFH1YLR223C 3258 nt1.18□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 SLD3YGL113W 2007 nt1.17□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.17□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.17□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YDL206WYDL206W 2289 nt1.17□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 NUT1YGL151W 3399 nt1.16□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YDL196WYDL196W 330 nt1.16□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YOR345CYOR345C 351 nt1.16□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YLL054CYLL054C 2532 nt1.16□□□□□ -2.22
RBD2Q12270 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.15□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 FIG4YNL325C 2640 nt1.15□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 Q0032Q0032 291 nt1.14□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YJL182CYJL182C 318 nt1.14□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 snR52snR52 92 nt1.14□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 MMS4YBR098W 2076 nt1.14□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 ROM2YLR371W 4071 nt1.14□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YGR151CYGR151C 336 nt1.13□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YJL150WYJL150W 303 nt1.13□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.13□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 NUP188YML103C 4968 nt1.13□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 SMC1YFL008W 3678 nt1.12□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YLL020CYLL020C 306 nt1.12□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 CDC39YCR093W 6327 nt1.12□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 SWI4YER111C 3282 nt1.1□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 STO1YMR125W 2586 nt1.09□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 ALY2YJL084C 3141 nt1.09□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YAR009CYAR009C 3591 nt1.09□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 YNL338WYNL338W 159 nt1.09□□□□□ -2.23
RBD2Q12270 SET3YKR029C 2256 nt1.08□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 PRP39YML046W 1890 nt1.08□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 YLR294CYLR294C 330 nt1.08□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 GEA2YEL022W 4380 nt1.08□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 PAA1YDR071C 576 nt1.07□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.07□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 YNL211CYNL211C 261 nt1.07□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 RPS30BYOR182C 192 nt1.07□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.07□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 TRS65YGR166W 1683 nt1.07□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 APL3YBL037W 3078 nt1.06□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.06□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 COY1YKL179C 2040 nt1.06□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 PAN2YGL094C 3348 nt1.05□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.05□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 snR46snR46 197 nt1.05□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 STB6YKL072W 2301 nt1.04□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 EAF1YDR359C 2949 nt1.04□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 LAA1YJL207C 6045 nt1.04□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 WAR1YML076C 2835 nt1.04□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 NUP145YGL092W 3954 nt1.04□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 BUD3YCL014W 4911 nt1.04□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 PMP1YCR024C-A 123 nt1.03□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.03□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 COX12YLR038C 252 nt1.03□□□□□ -2.24
RBD2Q12270 NUP192YJL039C 5052 nt1.02□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 TTI1YKL033W 3117 nt1.02□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.02□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.02□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 NUP157YER105C 4176 nt1.02□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 VAM6YDL077C 3150 nt1.02□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 YEL073CYEL073C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 CMC4YMR194C-B 222 nt1.01□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 KAP120YPL125W 3099 nt1□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 YPL044CYPL044C 549 nt0.99□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 HAL9YOL089C 3093 nt0.98□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.98□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 NOP9YJL010C 2001 nt0.98□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.97□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 BEM2YER155C 6504 nt0.97□□□□□ -2.25
RBD2Q12270 PRP16YKR086W 3216 nt0.96□□□□□ -2.26
RBD2Q12270 MSH3YCR092C 3057 nt0.96□□□□□ -2.26
RBD2Q12270 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.96□□□□□ -2.26
RBD2Q12270 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.96□□□□□ -2.26
RBD2Q12270 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.96□□□□□ -2.26
RBD2Q12270 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.95□□□□□ -2.26
RBD2Q12270 YLR282CYLR282C 342 nt0.95□□□□□ -2.26
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