Protein–RNA interactions for Protein: Q12263

GIN4, Serine/threonine-protein kinase GIN4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIN4Q12263 SMC4YLR086W 4257 nt1.78□□□□□ -2.12
GIN4Q12263 YJL022WYJL022W 309 nt1.78□□□□□ -2.12
GIN4Q12263 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.78□□□□□ -2.12
GIN4Q12263 YLL054CYLL054C 2532 nt1.78□□□□□ -2.12
GIN4Q12263 CLU1YMR012W 3834 nt1.77□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 BRR2YER172C 6492 nt1.77□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 PAN2YGL094C 3348 nt1.77□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 MMS4YBR098W 2076 nt1.77□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.77□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 YDL196WYDL196W 330 nt1.76□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.75□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 FIG4YNL325C 2640 nt1.74□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.74□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 RSM22YKL155C 1887 nt1.73□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 YGR151CYGR151C 336 nt1.73□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 snR14snR14 160 nt1.72□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 snR46snR46 197 nt1.72□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 PIK1YNL267W 3201 nt1.72□□□□□ -2.13
GIN4Q12263 AZF1YOR113W 2745 nt1.71□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YJL150WYJL150W 303 nt1.71□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YOR345CYOR345C 351 nt1.71□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 CCH1YGR217W 6120 nt1.7□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.7□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.7□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 HKR1YDR420W 5409 nt1.7□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.69□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 FYV8YGR196C 2454 nt1.68□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YAR009CYAR009C 3591 nt1.68□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.68□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 YLR294CYLR294C 330 nt1.67□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 HAL9YOL089C 3093 nt1.67□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 SEC3YER008C 4011 nt1.67□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 MDS3YGL197W 4464 nt1.66□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 SWI4YER111C 3282 nt1.66□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 APL1YJR005W 2103 nt1.66□□□□□ -2.14
GIN4Q12263 SET3YKR029C 2256 nt1.64□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 PET127YOR017W 2403 nt1.64□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 LAA1YJL207C 6045 nt1.64□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.64□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 RPL33BYOR234C 324 nt1.64□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 PRP39YML046W 1890 nt1.63□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 RAD9YDR217C 3930 nt1.62□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 PAA1YDR071C 576 nt1.62□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.62□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 STO1YMR125W 2586 nt1.62□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.61□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 IML1YJR138W 4755 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 TRM732YMR259C 4263 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 APL3YBL037W 3078 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 RPS30BYOR182C 192 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 snR52snR52 92 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 COY1YKL179C 2040 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 TRS65YGR166W 1683 nt1.6□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 NUP145YGL092W 3954 nt1.59□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 TTI1YKL033W 3117 nt1.59□□□□□ -2.15
GIN4Q12263 SMC1YFL008W 3678 nt1.59□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 PAU12YGR294W 363 nt1.58□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.58□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 YNL211CYNL211C 261 nt1.58□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 PAU24YBR301W 363 nt1.58□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 ROM2YLR371W 4071 nt1.57□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 WAR1YML076C 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 YEL073CYEL073C 324 nt1.56□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 COX12YLR038C 252 nt1.56□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 CDC25YLR310C 4770 nt1.56□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 PMP1YCR024C-A 123 nt1.55□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 YNL338WYNL338W 159 nt1.55□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.55□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 NUP188YML103C 4968 nt1.55□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 EAF1YDR359C 2949 nt1.55□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 YLL020CYLL020C 306 nt1.54□□□□□ -2.16
GIN4Q12263 NST1YNL091W 3723 nt1.52□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 CMC4YMR194C-B 222 nt1.52□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.52□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 NOP9YJL010C 2001 nt1.52□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.5□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.49□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.49□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.49□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.48□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 YPL044CYPL044C 549 nt1.48□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 NUP157YER105C 4176 nt1.48□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.47□□□□□ -2.17
GIN4Q12263 COX5BYIL111W 456 nt1.46□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 STB6YKL072W 2301 nt1.46□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 RPL26BYGR034W 384 nt1.45□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 CDC39YCR093W 6327 nt1.45□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 GEA2YEL022W 4380 nt1.44□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.42□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 YLR282CYLR282C 342 nt1.42□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.42□□□□□ -2.18
GIN4Q12263 ASE1YOR058C 2658 nt1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 114.1 ms