Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.39□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 RPL33BYOR234C 324 nt1.39□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 PET127YOR017W 2403 nt1.39□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 WAR1YML076C 2835 nt1.38□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 YBR064WYBR064W 429 nt1.38□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 DOP1YDR141C 5097 nt1.37□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 YPR117WYPR117W 7470 nt1.36□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 YNL028WYNL028W 318 nt1.36□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 CSE2YNR010W 450 nt1.36□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 YOL014WYOL014W 375 nt1.36□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 YOR218CYOR218C 420 nt1.36□□□□□ -2.19
NYV1Q12255 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.33□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.33□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 IES4YOR189W 351 nt1.33□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 ISD11YER048W-A 285 nt1.31□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.31□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 RAD61YDR014W 1944 nt1.3□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 OLI1Q0130 231 nt1.3□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.3□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.3□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 RAD9YDR217C 3930 nt1.3□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 YDL073WYDL073W 2955 nt1.29□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 NOP9YJL010C 2001 nt1.28□□□□□ -2.2
NYV1Q12255 AHC1YOR023C 1701 nt1.27□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 PAA1YDR071C 576 nt1.27□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.27□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 SPT7YBR081C 3999 nt1.26□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.26□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.26□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.25□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 CMC4YMR194C-B 222 nt1.25□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YOR015WYOR015W 360 nt1.25□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YOR282WYOR282W 321 nt1.25□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YPL044CYPL044C 549 nt1.24□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 BIR1YJR089W 2865 nt1.24□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 MCM10YIL150C 1716 nt1.23□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YDL196WYDL196W 330 nt1.23□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YGR069WYGR069W 336 nt1.23□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 ASE1YOR058C 2658 nt1.22□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.22□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 YSP1YHR155W 3687 nt1.22□□□□□ -2.21
NYV1Q12255 ECM12YHR021W-A 456 nt1.21□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.21□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.21□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YNL211CYNL211C 261 nt1.21□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 SCC2YDR180W 4482 nt1.21□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 PMP1YCR024C-A 123 nt1.2□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 SGF11YPL047W 300 nt1.2□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 BEM2YER155C 6504 nt1.19□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YER181CYER181C 324 nt1.19□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YGL052WYGL052W 306 nt1.19□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 APL1YJR005W 2103 nt1.19□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 SMC1YFL008W 3678 nt1.19□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YMR160WYMR160W 2451 nt1.18□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 RPL26BYGR034W 384 nt1.18□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.17□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.16□□□□□ -2.22
NYV1Q12255 YPR092WYPR092W 306 nt1.15□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.13□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.13□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.13□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 LTE1YAL024C 4308 nt1.13□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 HAL9YOL089C 3093 nt1.12□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.12□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 SEC8YPR055W 3198 nt1.12□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.11□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 BFR2YDR299W 1605 nt1.1□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 GEA2YEL022W 4380 nt1.09□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 UTP8YGR128C 2142 nt1.09□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.09□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 snR49snR49 165 nt1.09□□□□□ -2.23
NYV1Q12255 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.08□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.08□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.07□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.07□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 VAM6YDL077C 3150 nt1.07□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 snR74snR74 88 nt1.06□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.06□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.06□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 BEM3YPL115C 3387 nt1.05□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.05□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.05□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.04□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 snR190snR190 190 nt1.03□□□□□ -2.24
NYV1Q12255 BUD3YCL014W 4911 nt1.01□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.01□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 COX5BYIL111W 456 nt1.01□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 IQG1YPL242C 4488 nt1□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 snR55snR55 98 nt1□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 YLR282CYLR282C 342 nt0.99□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 PRP5YBR237W 2550 nt0.98□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 YLR041WYLR041W 321 nt0.98□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.98□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.98□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 YKU70YMR284W 1809 nt0.98□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 CHS6YJL099W 2241 nt0.97□□□□□ -2.25
NYV1Q12255 FYV10YIL097W 1551 nt0.97□□□□□ -2.25
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