Protein–RNA interactions for Protein: Q12142

ATG9, Autophagy-related protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG9Q12142 SET3YKR029C 2256 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 NUP188YML103C 4968 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 snR74snR74 88 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 RRT15YLR162W-A 189 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 SGF11YPL047W 300 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 WAR1YML076C 2835 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 NUP145YGL092W 3954 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 SPG3YDR504C 384 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.28□□□□□ -2.2
ATG9Q12142 YCS4YLR272C 3531 nt1.28□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 YLL020CYLL020C 306 nt1.27□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 YKU70YMR284W 1809 nt1.26□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 OLI1Q0130 231 nt1.26□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 NPR2YEL062W 1848 nt1.26□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 GEA2YEL022W 4380 nt1.26□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 EAF1YDR359C 2949 nt1.25□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.25□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 SEC3YER008C 4011 nt1.25□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 YGR130CYGR130C 2451 nt1.25□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 RSM22YKL155C 1887 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 MSN5YDR335W 3675 nt1.24□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 ISD11YER048W-A 285 nt1.23□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 DOP1YDR141C 5097 nt1.23□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 APL1YJR005W 2103 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 VAM6YDL077C 3150 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 BLI1YKL061W 342 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 JLP2YMR132C 627 nt1.22□□□□□ -2.21
ATG9Q12142 YDL196WYDL196W 330 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 YOR302WYOR302W 78 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 RAD9YDR217C 3930 nt1.21□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 ULI1YFR026C 510 nt1.2□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 YNL211CYNL211C 261 nt1.2□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.2□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 BEM2YER155C 6504 nt1.2□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 CDC39YCR093W 6327 nt1.19□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 PAA1YDR071C 576 nt1.19□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 SCC2YDR180W 4482 nt1.19□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 IML1YJR138W 4755 nt1.18□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 CMC4YMR194C-B 222 nt1.18□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.17□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 SIP4YJL089W 2490 nt1.16□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 STB6YKL072W 2301 nt1.16□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.16□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 NOP9YJL010C 2001 nt1.16□□□□□ -2.22
ATG9Q12142 YEL014CYEL014C 306 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 YPL044CYPL044C 549 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 CLU1YMR012W 3834 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 SPT7YBR081C 3999 nt1.15□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 YPR117WYPR117W 7470 nt1.14□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 APQ12YIL040W 417 nt1.14□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 YOR345CYOR345C 351 nt1.14□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 NUP157YER105C 4176 nt1.14□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.13□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 ROM2YLR371W 4071 nt1.13□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 TTI1YKL033W 3117 nt1.12□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 RPL26BYGR034W 384 nt1.12□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 RPS30BYOR182C 192 nt1.11□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 PAM16YJL104W 450 nt1.09□□□□□ -2.23
ATG9Q12142 NST1YNL091W 3723 nt1.09□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 COY1YKL179C 2040 nt1.08□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.08□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YJR029WYJR029W 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.07□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 COX12YLR038C 252 nt1.07□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.06□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.05□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YLR282CYLR282C 342 nt1.05□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.04□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 snR190snR190 190 nt1.04□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.03□□□□□ -2.24
ATG9Q12142 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 COX5BYIL111W 456 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 YML002WYML002W 2214 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 YNL337WYNL337W 255 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 snR52snR52 92 nt1.02□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.01□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 UTP8YGR128C 2142 nt1□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 SEC8YPR055W 3198 nt1□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 BFR2YDR299W 1605 nt1□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.99□□□□□ -2.25
ATG9Q12142 PAU24YBR301W 363 nt0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms