Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms