Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms