Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms