Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TFF3Q07654 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFF3Q07654 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms