Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms