Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms