Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms