Protein–RNA interactions for Protein: Q04364

YMR018W, TPR repeat-containing protein YMR018W, yeastyeast

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR018WQ04364 ALG13YGL047W 609 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 CMC4YMR194C-B 222 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 MCM10YIL150C 1716 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 SCC2YDR180W 4482 nt1.11□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 RPS30BYOR182C 192 nt1.11□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 YOR282WYOR282W 321 nt1.11□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 YOR218CYOR218C 420 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR018WQ04364 PMP1YCR024C-A 123 nt1.08□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 PAA1YDR071C 576 nt1.08□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 CSE2YNR010W 450 nt1.08□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 YPL044CYPL044C 549 nt1.08□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 UTP20YBL004W 7482 nt1.08□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 ECM12YHR021W-A 456 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 YNL211CYNL211C 261 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 IES4YOR189W 351 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 PAU12YGR294W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 YNL028WYNL028W 318 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 PAU24YBR301W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 YJR029WYJR029W 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 BEM2YER155C 6504 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 SGF11YPL047W 300 nt1.04□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 YSP1YHR155W 3687 nt1.04□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 BFR2YDR299W 1605 nt1.04□□□□□ -2.24
YMR018WQ04364 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YNL146WYNL146W 303 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 RPL26BYGR034W 384 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YOR015WYOR015W 360 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 HAL9YOL089C 3093 nt1□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 GEA2YEL022W 4380 nt1□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 RAD61YDR014W 1944 nt1□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 snR65snR65 100 nt1□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 PAM16YJL104W 450 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 SMC1YFL008W 3678 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR018WQ04364 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 SEC8YPR055W 3198 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 BUD3YCL014W 4911 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 LTE1YAL024C 4308 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 QCR9YGR183C 201 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 DOP1YDR141C 5097 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YGR069WYGR069W 336 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 RKR1YMR247C 4689 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 BEM3YPL115C 3387 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 CHS6YJL099W 2241 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YGL052WYGL052W 306 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR018WQ04364 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.9□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 FYV10YIL097W 1551 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YPR092WYPR092W 306 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 snR190snR190 190 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 PRP5YBR237W 2550 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 NPR2YEL062W 1848 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 IQG1YPL242C 4488 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 SEC1YDR164C 2175 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YMR160WYMR160W 2451 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 snR74snR74 88 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR018WQ04364 YLR282CYLR282C 342 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 COX5BYIL111W 456 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 YLR041WYLR041W 321 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 YCR022CYCR022C 345 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 OST4YDL232W 111 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 COY1YKL179C 2040 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 YML002WYML002W 2214 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 ULI1YFR026C 510 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR018WQ04364 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.4 ms