Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YMR321CYMR321C 318 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 WAR1YML076C 2835 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 CSE2YNR010W 450 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 VIK1YPL253C 1944 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YJR029WYJR029W 5268 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YOR218CYOR218C 420 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 KAP120YPL125W 3099 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YDR344CYDR344C 444 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 RPS27BYHR021C 249 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 snR65snR65 100 nt1.11□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YBR206WYBR206W 324 nt1.11□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 COG8YML071C 1824 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YJL120WYJL120W 324 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 YNL028WYNL028W 318 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 VAM6YDL077C 3150 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 BEM2YER155C 6504 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 SPO21YOL091W 1830 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF1Q04048 ECM12YHR021W-A 456 nt1.08□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 GEA2YEL022W 4380 nt1.08□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 ISD11YER048W-A 285 nt1.07□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 RAD61YDR014W 1944 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 SCC2YDR180W 4482 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YMR160WYMR160W 2451 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YGR069WYGR069W 336 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YBR064WYBR064W 429 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 MCM10YIL150C 1716 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YDL196WYDL196W 330 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 OLI1Q0130 231 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YOL014WYOL014W 375 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YDL073WYDL073W 2955 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 IES4YOR189W 351 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF1Q04048 YOR282WYOR282W 321 nt1.02□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 PRP16YKR086W 3216 nt1.01□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 SGF11YPL047W 300 nt1.01□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 PAA1YDR071C 576 nt1□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 YER181CYER181C 324 nt1□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 YML099W-AYML099W-A 330 nt1□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 YPL044CYPL044C 549 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 CMC4YMR194C-B 222 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF1Q04048 NOP9YJL010C 2001 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YGL052WYGL052W 306 nt0.95□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YNL211CYNL211C 261 nt0.95□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YPR092WYPR092W 306 nt0.95□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 PMP1YCR024C-A 123 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 RPL26BYGR034W 384 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YOR015WYOR015W 360 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.93□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 snR49snR49 165 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 BIR1YJR089W 2865 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF1Q04048 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.9□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.89□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.89□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.89□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 BFR2YDR299W 1605 nt0.89□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 snR55snR55 98 nt0.88□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 LTE1YAL024C 4308 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YCR022CYCR022C 345 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.85□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.84□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.84□□□□□ -2.27
SYF1Q04048 ASE1YOR058C 2658 nt0.84□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 snR74snR74 88 nt0.83□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.83□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 ULP2YIL031W 3105 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 SEC8YPR055W 3198 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.81□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 RKR1YMR247C 4689 nt0.81□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 snR190snR190 190 nt0.81□□□□□ -2.28
SYF1Q04048 SEC1YDR164C 2175 nt0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms