Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms