Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC25A11Q02978 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC25A11Q02978 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms