Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms