Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms