Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLH2Q02577 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms