Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ID3Q02535 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ID3Q02535 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ID3Q02535 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ID3Q02535 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ID3Q02535 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms