Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALDH6A1Q02252 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms