Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms