Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNC1Q01954 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms