Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms