Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX3P78415 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX3P78415 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX3P78415 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX3P78415 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX3P78415 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX3P78415 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX3P78415 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms