Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms