Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA52P62987 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms