Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL23P62829 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL23P62829 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms