Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms