Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFM1P61960 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFM1P61960 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UFM1P61960 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UFM1P61960 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
UFM1P61960 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UFM1P61960 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UFM1P61960 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFM1P61960 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms