Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VBP1P61758 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VBP1P61758 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms