Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARF3P61204 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARF3P61204 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARF3P61204 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms