Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms