Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA9P57773 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA9P57773 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA9P57773 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA9P57773 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA9P57773 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA9P57773 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA9P57773 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms