Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCGRTP55899 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms