Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELLP55199 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ELLP55199 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELLP55199 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELLP55199 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELLP55199 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELLP55199 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELLP55199 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELLP55199 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELLP55199 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms