Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB4P54760 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms