Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA8P53708 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms