Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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