Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC3P51654 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC3P51654 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC3P51654 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC3P51654 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms