Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms