Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms