Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF6P49848 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF6P49848 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF6P49848 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF6P49848 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF6P49848 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF6P49848 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms