Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms