Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSEN2P49810 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms