Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPAP49450 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms