Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTAP49354 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTAP49354 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTAP49354 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTAP49354 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTAP49354 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTAP49354 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTAP49354 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTAP49354 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTAP49354 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FNTAP49354 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms