Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POU3F4P49335 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms